После установки Black Mesa Source не появляется в списке Steam

Ну не появляется и ладно :)
Создадим ярлык, указав в качестве программы строку:

"C:\Program Files (x86)\Steam\Steam.exe" -applaunch 218 -game "C:\Program Files (x86)\Steam\steamapps\sourcemods\BMS"

Жирным выделены папки, где установлены Steam и Black Mesa соответственно.
На моем компьютере ярлык для запуска выглядит так:
D:\Games\Steam\Steam.exe -applaunch 218 -game "D:\Games\Black Mesa"